Las líneas de investigación corresponden a las áreas de trabajo de los docentes responsables de las asignaturas vinculados al programa.
Entre otras se encuentran:
- Grupo de Investigación en Derechos Colectivos y Ambientales - GIDCA
- Grupo de Investigación Política y Legislación sobre Biodiversidad, recursos genéticos y conocimiento tradicional - PLEBIO
- Grupo de Investigación Derecho y Desarrollo: PROMETEO - Propiedad Intelectual y Biotecnologia: Biodiversidad y Tratados de Libre Comercio, Organismos modificados genéticamente, Conocimiento tradicional
- Grupo de Ingeniería Genética de Plantas
- Grupo Fisiología del Estrés y Biodiversidad en Plantas y Microorganismos
- Grupo Estudio y Aprovechamiento de Productos Naturales Marinos y Frutas de Colombia
- Grupo de Investigación Bioprocesos y Bioprospección - Bioprosprección y Biotecnología
- Grupo de Investigación, Política y Derecho Ambiental PODEA - Biodiversidad, Políticas Públicas y Relaciones Internacionales